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Spécialité médicale · groupe « Investigation 1 (imagerie, anatomopathologie) »

Anatomopathologie : l'internat, les rangs, le métier

Le pathologiste examine à l'œil nu puis au microscope les tissus et les cellules prélevés (biopsies, pièces opératoires, frottis, ponctions, autopsies) pour poser le diagnostic de certitude, en particulier celui des cancers. Il fournit aussi les facteurs pronostiques et les tests qui orientent le choix des traitements. Il exerce en CHU, en centre hospitalier ou en structure privée de pathologie.

Internat
5 ans
Postes en 2026
76dont 4 à Lyon
Rang limite 2025
6 608Lyon : 4 131
Revenu libéral moyen
178 600 €par an avant impôt (revenu libéral moyen, DREES 2021)

Photo de Arthur Mercader Vérifié le 25 octobre 2026 par Arthur Mercader, étudiant en 6ème année de médecine

Le métier

  • Macroscopie : examen et prélèvement des pièces opératoires ; examens extemporanés pendant une intervention.
  • Lecture des lames au microscope, avec colorations spéciales et immunohistochimie, en intégrant le contexte clinique, radiologique et biologique.
  • Pathologie moléculaire et tests compagnons qui guident les traitements ciblés des cancers ; numérisation croissante des lames.
  • Rédaction du compte rendu et participation aux réunions de concertation pluridisciplinaire (RCP).
  • Autopsies et fœtopathologie dans certains services.
  • Lieux : CHU, centres hospitaliers, cabinets et laboratoires privés de pathologie ; pas de gardes de nuit dans la spécialité.

L'internat : 5 ans en trois phases

Le DES (diplôme d'études spécialisées) est le diplôme de ta spécialité, préparé pendant l'internat. Tu y entres en 6ème année, après le classement national qui combine les EDN (épreuves dématérialisées nationales, 60 %), les ECOS (examens cliniques, 30 %) et ton parcours (10 %) : comment ça marche.

Anatomopathologie · 10 semestres Ton internat, phase par phase
Choix du DESfin de 6ème année Fin du socleaprès 1 an Thèse soutenuetu deviens docteur junior DES validéspécialiste en 5 ans
  1. 1 Phase socle 1 an (2 semestres) Découvrir la spécialité et acquérir les bases, encadré de près. 2 stages de 6 moisÉvaluation Le détail
  2. 2 Phase d'approfondissement 3 ans (6 semestres) Approfondir et prendre des responsabilités, stage après stage. 6 stages de 6 mois Le détail
  3. 3 Phase de consolidation 1 an (docteur junior) Docteur junior : thèse soutenue, autonomie supervisée avant d’exercer seul. ÉvaluationMémoire Le détail
  1. 1

    Phase socle 1 an (2 semestres)

    • 1 stage en anatomie et cytologie pathologiques (lieu hospitalier agréé à titre principal).
    • 1 stage libre.
    • Évaluation : examen pratique de macroscopie et d'examen extemporané, examen régional de lecture de lames.
  2. 2

    Phase d'approfondissement 3 ans (6 semestres)

    • 4 stages en anatomie et cytologie pathologiques.
    • 1 stage dans un lieu agréé en anatomie et cytologie pathologiques ayant une activité de pathologie moléculaire, de génétique constitutionnelle ou de génétique somatique des tumeurs.
    • 1 stage libre.
    • Entretien annuel avec un référent ; pour les surspécialités complexes (néphropathologie, neuropathologie, fœtopathologie), diagnostics simples attendus.
  3. 3

    Phase de consolidation 1 an (docteur junior)

    • Stages de niveau III en anatomie et cytologie pathologiques, hospitaliers ou mixtes (hospitalier et extrahospitalier) ; selon l'arrêté du 5 juin 2026, deux stages d'un semestre remplacent le stage d'un an.
    • Au moins 1 000 examens histologiques et cytologiques cosignés.
    • Mémoire de DES ; certification européenne encouragée.

10 semestres, dont au moins 7 dans la spécialité, au moins 4 dans un lieu avec encadrement universitaire et au moins 1 dans un lieu sans encadrement universitaire. Maquette révisée par l'arrêté du 19 mars 2019. Pas d'option. Le DES relève de la discipline médicale (et non biologique) dans l'arrêté du 21 avril 2017.

Options et formations spécialisées transversales

Option, FST, DIU : c'est quoi ?Les sur-spécialisations en médecine, expliquées simplement

Les FST accessibles 1

Une formation spécialisée transversale (FST) dure en général un an (deux semestres) pendant l'internat et ajoute une compétence reconnue à ta spécialité. La maquette en indique une liste ; la candidature dépend de ton projet et de l'accord des coordonnateurs.

  • Fœtopathologie2 semestresExamen des fœtus et des placentas pour diagnostiquer les anomalies du développement et les causes de mort fœtale.

Rang limite et postes

Rang du dernier interne affecté en 2025, ville par ville

Lyon 4 131 · Paris 4 922 · dernier rang en France 6 608 (Antilles) · en 2024 : 5 561, Lyon 3 658

Comparer avec les autres spécialités
Dérouler le tableau : le rang limite dans les 28 villes (2025 et 2024)Replier le tableau
VillePremier affecté 2025Dernier affecté 2025Dernier affecté 2024
Nice1 3061 3064 644
Montpellier1 1743 4404 360
Nancy2 9953 6283 581
Strasbourg3 6293 6293 361
Toulouse3 5673 6844 578
Grenoble8963 8864 707
Bordeaux2 5574 1093 675
Lyon3 3264 1313 658
Amiens3 7174 2414 701
Poitiers4 4824 4824 023
Marseille3 4344 8294 132
Brest2 7864 8735 488
Paris1 0074 9224 458
Nantes4 9364 9875 153
Lille3 6935 0364 882
Rennes4 3725 1304 981
Reims5 0905 1924 240
Dijon2 0045 2075 444
Rouen3 3355 2093 529
Tours5 2745 2975 206
Angers5 1505 5235 024
Limoges5 6125 6445 298
Besançon4 8255 6473 839
Clermont-Ferrand3 9075 6864 829
Caen4 7145 9333 570
Saint-Étienne6 0326 0324 944
La Réunion6 5096 509–
Antilles6 1586 6085 561

Le nom de la ville renvoie à sa fiche : facultés, places en 2ème année, Parcoursup et vie étudiante.

Postes ouverts à l'internat dans cette spécialité

202460 postes · 2 à Lyon
202568 postes · 3 à Lyon
202676 postes · 4 à Lyon

Sources : Centre national de gestion, rangs limites, liste principale 2025 (fichier tableur) · Centre national de gestion, rangs limites des épreuves nationales, campagne 2024, liste principale · arrêtés des 7 juillet 2024, 30 juillet 2025 et 4 août 2026 (Journal officiel). Depuis 2024, le rang est une position dans le classement du groupe de spécialités « Investigation 1 (imagerie, anatomopathologie) », pas dans un classement national unique.

Combien gagne un anatomopathologiste ?

À l'hôpital public

Même grille pour toutes les spécialités : interne de 1 617 € à 2 371 € brut par mois, puis praticien hospitalier de 4 634 € à 9 368 €, gardes en plus (montants au 1er juillet 2023).

En libéral

178 600 € par an en moyenne avant impôt, soit 14 883 € par mois (revenu libéral moyen mesuré par la DREES en 2021). Détail, actes et simulateur ci-dessous.

Revenus en libéral · chiffres officiels et simulateur

Combien gagne un anatomopathologiste en libéral ?

  • 14 883 €par mois en moyenne, avant impôt
    revenu libéral moyen, DREES 2021
  • 140 k€bénéfice moyen par an
    CARMF 2022
  • × 6,9écart entre les 10 % qui gagnent le plus et les 10 % qui gagnent le moins

Le pathologiste ne voit presque jamais de patient : il examine au microscope les biopsies et les pièces opératoires envoyées par les chirurgiens, gastro-entérologues et dermatologues, et pose le diagnostic des cancers. Chaque examen est un acte CCAM, de 28 € pour une biopsie à plus de 100 € pour une pièce de cancer. Le revenu dépend du volume de lames lues et de l'organisation du cabinet, qui emploie des techniciens et des automates. Les cabinets libéraux se regroupent en sociétés (SEL), et 75 % des pathologistes restent en secteur 1.

Ce que facture un anatomopathologiste

  • Consultation de spécialisteCS + MCS · très rare : le pathologiste ne voit presque jamais de patient31,50 €
Voir les actes en plus possibles10
  • Examen d'une biopsieZZQX162 · 28 € au 1er janvier 2025 ; lecture de lames préparées par les techniciens28 €
  • Examen d'une ou deux exérèses de polypes du côlonHHQX00551,53 €
  • Examen d'une pièce d'exérèse de peau (recherche de cancer)QZQX00447,55 €
  • Examen d'une pièce de mastectomie pour cancerQEQX004 · examen macroscopique, nombreuses lames, compte rendu standardisé108,18 €
  • Examen d'une pièce de colectomie ou de prostatectomie pour cancerCCAM (selon l'organe) · ordre de grandeur110 €
  • Examen de biopsies multiples de la prostateordre de grandeur90 €
  • Examen extemporané pendant une opérationordre de grandeur ; réponse au chirurgien en 20 à 30 minutes60 €
  • Immunohistochimie (par anticorps)CCAM (supplément) · ordre de grandeur ; plusieurs anticorps par cancer, pèse lourd dans le chiffre d'affaires30 €
  • Lecture d'un frottis cervico-utérinordre de grandeur15 €
  • Lecture d'une cytoponction (thyroïde, sein, ganglion)ordre de grandeur30 €
Voir les actes possibles avec une sur-spécialisation, après l'internat5

FST

  • Examen d'un fœtus ou d'un placentaavec Fœtopathologie · ordre de grandeur150 €

DIU

  • Cytopathologie d'expertise (liquides, ponctions)avec DIU Cytopathologie · ordre de grandeur35 €
  • Tests de pathologie moléculaire des cancersavec DIU Pathologie moléculaire · RIHN (actes innovants) · ordre de grandeur ; actes innovants financés à part, souvent en plateforme hospitalière200 €
  • Examen d'une biopsie rénaleavec DIU Néphropathologie · ordre de grandeur ; microscopie optique et immunofluorescence100 €

DU

  • Dermatopathologie (relecture, lésions mélanocytaires)avec DU Dermatopathologie · ordre de grandeur50 €

Option, FST, DIU : ce que sont les sur-spécialisations en médecine, et quand on les fait.

Tarifs de base de l'Assurance maladie (secteur 1). En secteur 2, le médecin peut y ajouter un dépassement ; les actes hors nomenclature sont à prix libre.

Simule une année d'activité

Ajuster les hypothèses (semaines, charges)

Revenu avant impôt

15 141 €par mois

  • Revenu
  • Cotisations et CSG
  • Charges
  • Chiffre d'affaires

À lire avant de comparer. Les chiffres officiels sont des moyennes : ils mêlent temps partiels, débuts d'installation et fins de carrière. Les profils du simulateur viennent de l'étude LPS : construits sur les tarifs de l'Assurance maladie et les statistiques officielles (DREES, CARMF, HCAAM), puis croisés avec les témoignages de plus de 800 praticiens (20 à 25 par spécialité), à Lyon et dans d'autres villes. Le profil moyen est calé sur la moyenne officielle ; le profil le plus haut décrit une activité rare, possible avec une organisation dédiée, pas un revenu courant. Les cotisations suivent le barème CARMF 2026 et une approximation de l'URSSAF ; seul un expert-comptable fait le calcul exact. Notre méthode.

À l'hôpital. À l'hôpital, la grille des praticiens hospitaliers va de 55 608 € à 112 417 € brut par an (montants au 1er juillet 2023), plus les gardes, les astreintes et 1 010 € par mois d'indemnité d'engagement exclusif (IESPE) pour qui renonce à l'activité libérale. Le pathologiste hospitalier (CHU, centres anticancer) fait les examens les plus complexes (biologie moléculaire des tumeurs, examens extemporanés au bloc, autopsies) et n'a presque pas de gardes.

Sources : Assurance maladie, CCAM en ligne : la référence officielle des tarifs des actes techniques · DREES, Études et résultats n° 1322, revenus d'activité 2021 des médecins libéraux (décembre 2024) · CARMF, BNC 2022 par spécialité et par secteur (communiqué du 7 novembre 2023) · Aide au codage, fiche CCAM ZZQX162 (examen histopathologique de biopsie, 28 € au 1er janvier 2025) · CNAM, CCAM v72 des actes d'anatomie et cytologie pathologiques (1er avril 2023), reproduite par le CNPHG · SideCare, fiche CCAM QZQX004 (pièce d'exérèse de peau, 47,55 €)

Secteur 1, secteur 2, gardes, primes, assistant ou chef de clinique : le salaire d'un médecin, étape par étape.

Remplacer en anatomopathologie

Dès quand ?5 semestresd'internat validés

Le remplacement, c'est le complément de revenu classique pendant l'internat, puis la porte d'entrée du libéral en début de carrière : tu prends le cabinet d'un médecin quelques jours pendant ses congés, sans rien investir, et tu découvres des façons d'exercer avant de t'installer.

Un interne du DES d'anatomie et cytologie pathologiques peut obtenir sa licence après 5 semestres validés : 4 en anatomie pathologique et 1 libre, soit au plus tôt en 3ème année.

Le partage des honoraires : Le cabinet de pathologie porte de lourdes charges (techniciens, automates, numérisation des lames) : le remplaçant est payé à la journée ou sur une part réduite des actes qu'il signe. Aucun taux public trouvé.

À l'hôpital et en clinique : Remplacements salariés en CDD dans les hôpitaux et les centres de lutte contre le cancer (offres de 2026 à Marseille et dans l'Aisne, rémunération « selon expérience »). Le remplacement peut se faire en partie à distance quand les lames sont numérisées. Avec sa licence, un interne peut aussi remplacer un médecin salarié d'un établissement privé, en contrat à durée déterminée limité à l'absence du titulaire.

La pathologie numérique (lames scannées) rend possible une partie du travail à distance.

Des offres réelles

Licence de remplacement, contrat, statut, cotisations : les remplacements en médecine, expliqués. Montants tirés d'offres réelles et croisés avec les témoignages de praticiens : notre méthode.

Sources : Code de la santé publique, annexe 41-1 (conditions de remplacement par DES, modifiée par le décret n° 2021-781 du 18 juin 2021), reproduction du Conseil national de l'Ordre des médecins · Conseil national de l'Ordre des médecins, fiche pratique « Remplacement d'un médecin libéral »

Les DIU et DU, ville par ville

Tu ne sais pas ce qu'est un DIU ? Les sur-spécialisations en médecine, en deux minutes.

Les diplômes interuniversitaires (DIU, portés par plusieurs universités) et d'université (DU) ajoutent une compétence pendant ou après l'internat. Chaque université crée les siens : 21 diplômes utiles dans cette spécialité, proposés dans 12 villes. Choisis ta ville ou cherche un mot.

Liste non exhaustive : l'offre change chaque année, vérifie sur le site de l'université avant de t'inscrire.

Les spécialités du même groupe

Elles partagent les mêmes coefficients au classement de 6ème année : ton rang est le même pour toutes les spécialités du groupe.

Questions fréquentes

Combien de temps dure l'internat d'anatomopathologie ?

Le DES d'anatomie et cytologie pathologiques dure 5 ans (10 semestres) : 1 an de phase socle, 3 ans d'approfondissement et 1 an de consolidation comme docteur junior. Au moins 7 semestres se passent dans la spécialité, dont un stage en pathologie moléculaire ou en génétique.

Que fait un anatomopathologiste ?

Il examine les prélèvements (biopsies, pièces opératoires, frottis) à l'œil nu puis au microscope, avec des techniques d'immunohistochimie et de biologie moléculaire, pour poser le diagnostic, notamment des cancers. Il rédige un compte rendu, donne des facteurs pronostiques et participe aux réunions de concertation avec les cliniciens.

Y a-t-il des gardes en anatomopathologie ?

Non, la spécialité ne comporte pas de gardes de nuit selon le syndicat des internes des hôpitaux de Paris. Les examens extemporanés, faits pendant une opération, se déroulent aux heures du bloc opératoire.

Un anatomopathologiste voit-il des patients ?

Rarement : il travaille surtout sur les prélèvements, mais en lien constant avec les chirurgiens, oncologues et radiologues, notamment en réunion de concertation pluridisciplinaire. Certains gestes, comme les ponctions cytologiques, peuvent se faire au contact du patient.

Quelles FST après un DES d'anatomopathologie ?

La maquette cite une seule FST indicative : la fœtopathologie, qui forme à l'examen des fœtus et des placentas. Pour d'autres orientations (pathologie moléculaire, dermatopathologie, néphropathologie), on passe plutôt par les stages et des DIU.

Combien gagne un anatomopathologiste ?

En libéral, un anatomopathologiste gagne en moyenne 178 600 € par an avant impôt (revenu libéral moyen mesuré par la DREES en 2021), soit environ 14 900 € par mois, après les frais du cabinet et les cotisations sociales. À l'hôpital public, il suit la grille des praticiens hospitaliers, de 55 608 € à 112 417 € brut par an, gardes en plus.

Combien peut gagner un anatomopathologiste en libéral ?

Tout dépend du volume d'actes, du secteur et des charges. Dans l'étude LPS, construite sur les tarifs de l'Assurance maladie et croisée avec les témoignages de 20 à 25 praticiens par spécialité, une activité soutenue donne environ 21 500 € par mois avant impôt (42 heures par semaine), et un très haut niveau d'activité, rare et organisé autour d'une équipe, environ 28 200 € par mois. Ce sont des scénarios, pas des moyennes.

Sources

Toutes les spécialités · Les études de médecine, année par année

Gratuit, en PDF

Le guide de la réforme en PDF.

14 pages pour tout comprendre : les trois blocs, les deux chances, Parcoursup 2027, les spécialités, Lyon. Envoyé par e-mail tout de suite.

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